Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BIN3Q9NQY0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms