Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRIP3Q9NQ35 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms