Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ASCL3Q9NQ33 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms