Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms