Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms