Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELL3Q9HB65 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms