Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms