Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms