Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MED28Q9H204 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms