Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms