Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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