Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms