Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms