Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF1Q9BYJ9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms