Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTRT3Q9BYD9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms