Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG6Q9BXT2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNG6Q9BXT2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms