Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms