Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIGD2AQ9BW72 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms