Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM4BQ9BQ04 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM4BQ9BQ04 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms