Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms