Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA3Q99758 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA3Q99758 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms