Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5Q99717 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD5Q99717 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms