Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms