Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT140Q96RY7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT140Q96RY7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms