Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms