Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms