Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF48Q96MX3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms