Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms