Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR1Q96JP9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms