Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC11Q96J66 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms