Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms