Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms