Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms