Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO3Q8TAP4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms