Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms