Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC197Q8NCU1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms