Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARRDC4Q8NCT1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms