Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH13Q8NBN7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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