Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L2Q8NAA4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms