Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX3Q8N9I9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms