Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RNF182Q8N6D2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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