Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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