Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC47Q8N1G4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms