Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms