Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms