Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PBRM1Q86U86 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms