Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms