Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC4Q7Z404 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms