Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3BQ7Z3V4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms