Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q71RC1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q71RC1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q71RC1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q71RC1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q71RC1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q71RC1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q71RC1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q71RC1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q71RC1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q71RC1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q71RC1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q71RC1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q71RC1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms